Работа в Москве, вакансия - Начинающий Python разработчик (работа с биологическими данными) • Москва - id275

Общее описание:

Отдел системной биологии и биоинформатики ищет начинающего Python разработчика для работы с биологическими данными (данными геномного секвенирования человека).

В прошлом году опубликовали самый масштабный проект с нашим участием: Базу данных популяционных частот генетических вариантов населения Российской Федерации. Для формирования Базы были проанализированы геномы 120 тысяч человек со всей России. В настоящее время мы продолжаем работу с данными и ищем Python разработчика для визуализации результатов исследований.

Что мы можем предложить:

• Очень много данных и мощная инфраструктура для их анализа.
• Прозрачные рабочие процессы: отслеживаем задачи в Gitlab.
• Светлый, просторный офис рядом с парком, в 10-15 минутах ходьбы от станции метро Щукинская и МЦД Стрешнево.
• Индивидуальное рабочее место с мощным ноутбуком и двумя мониторами.
• Возможности для карьерного роста.

Стек технологий:

• Языки разработки: Python, bash
• Работа с пайплайнами: Docker, CWL
• Совместная работа над кодом: GitLab

Обязанности:

• Поддержание и развитие существующих репозиториев.
• Рефакторинг кода.
• Разработка и ведение технической документации.
• Запуск расчетов, визуализация полученных результатов.
• Описание результатов и подготовка отчетов.
• Внедрение и тестирование новых алгоритмов анализа.

Работа предполагает более рутинный характер (85% рутины и 15% новизны).

Требования:

Основные:

• Уверенное владение Python, особенно библиотеками для работы с данными (Pandas, Numpy) и для визуализации данных (Matplotlib, Seaborn и др.).
• Умение грамотно документировать код, описывать работу скрипта в Readme.
• Опыт работы с bash, git.
• Знание английского языка на уровне чтения технической документации.
• Навыки самостоятельной работы готовность брать на себя ответственность за результат.
• Готовность заниматься методической работой, написанием технической документации.
• Быстрая обучаемость.
• Внимательность, аккуратность.

Организационные:

• Наличие диплома о высшем образовании. В приоритете техническое, математическое, биоинформатическое, медико-биологическое образование.
• Очное присутствие в офисе в Москве обязательно.

Будет плюсом:

• Знание основ генетики человека, популяционной генетики, молекулярной биологии.
• Понимание принципов работы технологий высокопроизводительного секвенирования.
• Опыт работы с биоинформатическими инструментами и базами данных (опыт обработки данных WGS, клинического анализа данных секвенирования или популяционных исследований будет большим преимуществом).
• Наличие открытых репозиториев.
• Умение работать с вычислительными кластерами.
• Опыт представления результатов в виде статей, докладов.
• Готовность участвовать в написании научных статей.
• Инициативность.

Условия:

• График работы: 9:30-18:00 (включая 30 минут на обед). При необходимости есть возможность сдвинуть время начала рабочего дня.
• Работа в офисе (метро Щукинская, МЦД Стрешнево). Удаленки нет.
• Размер заработной платы обсуждается индивидуально, зависит от знаний, опыта, навыков.
• Возможность прикрепления к ведомственной поликлинике.
• Парковка оговаривается индивидуально.

В отклике опишите свой опыт визуализации данных (желательно с примерами)